Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIK1P57059 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SIK1P57059 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIK1P57059 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIK1P57059 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SIK1P57059 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIK1P57059 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIK1P57059 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIK1P57059 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIK1P57059 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIK1P57059 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIK1P57059 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIK1P57059 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIK1P57059 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIK1P57059 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIK1P57059 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIK1P57059 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SIK1P57059 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIK1P57059 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIK1P57059 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIK1P57059 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIK1P57059 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIK1P57059 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIK1P57059 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIK1P57059 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIK1P57059 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIK1P57059 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIK1P57059 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIK1P57059 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIK1P57059 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIK1P57059 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIK1P57059 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIK1P57059 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIK1P57059 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIK1P57059 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIK1P57059 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIK1P57059 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SIK1P57059 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIK1P57059 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIK1P57059 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIK1P57059 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIK1P57059 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SIK1P57059 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SIK1P57059 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SIK1P57059 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIK1P57059 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIK1P57059 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIK1P57059 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIK1P57059 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIK1P57059 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIK1P57059 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIK1P57059 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIK1P57059 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIK1P57059 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIK1P57059 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIK1P57059 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIK1P57059 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIK1P57059 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIK1P57059 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIK1P57059 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIK1P57059 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SIK1P57059 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SIK1P57059 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIK1P57059 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIK1P57059 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIK1P57059 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIK1P57059 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIK1P57059 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIK1P57059 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIK1P57059 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIK1P57059 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIK1P57059 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIK1P57059 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIK1P57059 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIK1P57059 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SIK1P57059 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIK1P57059 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIK1P57059 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SIK1P57059 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIK1P57059 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIK1P57059 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIK1P57059 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIK1P57059 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIK1P57059 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIK1P57059 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIK1P57059 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIK1P57059 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIK1P57059 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIK1P57059 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIK1P57059 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIK1P57059 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIK1P57059 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SIK1P57059 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIK1P57059 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIK1P57059 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIK1P57059 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIK1P57059 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIK1P57059 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SIK1P57059 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIK1P57059 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms