Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSRP3P50461 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSRP3P50461 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms