Protein–RNA interactions for Protein: P49798

RGS4, Regulator of G-protein signaling 4, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGS4P49798 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RGS4P49798 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RGS4P49798 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RGS4P49798 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RGS4P49798 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RGS4P49798 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RGS4P49798 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RGS4P49798 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RGS4P49798 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RGS4P49798 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RGS4P49798 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RGS4P49798 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RGS4P49798 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RGS4P49798 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RGS4P49798 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RGS4P49798 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RGS4P49798 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RGS4P49798 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RGS4P49798 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RGS4P49798 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RGS4P49798 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RGS4P49798 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RGS4P49798 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RGS4P49798 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
RGS4P49798 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
RGS4P49798 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
RGS4P49798 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
RGS4P49798 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RGS4P49798 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RGS4P49798 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RGS4P49798 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RGS4P49798 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RGS4P49798 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RGS4P49798 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RGS4P49798 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RGS4P49798 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RGS4P49798 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RGS4P49798 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RGS4P49798 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RGS4P49798 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RGS4P49798 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RGS4P49798 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RGS4P49798 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RGS4P49798 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RGS4P49798 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RGS4P49798 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RGS4P49798 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RGS4P49798 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RGS4P49798 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RGS4P49798 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RGS4P49798 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RGS4P49798 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RGS4P49798 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RGS4P49798 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RGS4P49798 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RGS4P49798 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RGS4P49798 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RGS4P49798 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RGS4P49798 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RGS4P49798 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RGS4P49798 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RGS4P49798 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RGS4P49798 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RGS4P49798 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RGS4P49798 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RGS4P49798 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RGS4P49798 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RGS4P49798 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RGS4P49798 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RGS4P49798 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RGS4P49798 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RGS4P49798 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RGS4P49798 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RGS4P49798 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RGS4P49798 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RGS4P49798 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RGS4P49798 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RGS4P49798 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RGS4P49798 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RGS4P49798 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RGS4P49798 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RGS4P49798 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RGS4P49798 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RGS4P49798 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RGS4P49798 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RGS4P49798 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RGS4P49798 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RGS4P49798 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RGS4P49798 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RGS4P49798 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RGS4P49798 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RGS4P49798 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RGS4P49798 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RGS4P49798 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RGS4P49798 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RGS4P49798 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RGS4P49798 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RGS4P49798 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RGS4P49798 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RGS4P49798 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.3 ms