Protein–RNA interactions for Protein: P49447

CYB561, Cytochrome b561, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYB561P49447 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYB561P49447 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYB561P49447 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYB561P49447 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYB561P49447 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYB561P49447 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CYB561P49447 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CYB561P49447 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYB561P49447 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYB561P49447 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYB561P49447 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYB561P49447 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYB561P49447 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYB561P49447 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYB561P49447 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYB561P49447 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYB561P49447 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYB561P49447 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYB561P49447 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYB561P49447 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYB561P49447 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYB561P49447 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYB561P49447 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYB561P49447 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYB561P49447 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYB561P49447 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYB561P49447 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYB561P49447 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CYB561P49447 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CYB561P49447 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CYB561P49447 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CYB561P49447 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
CYB561P49447 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CYB561P49447 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYB561P49447 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYB561P49447 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYB561P49447 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYB561P49447 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYB561P49447 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CYB561P49447 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CYB561P49447 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYB561P49447 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYB561P49447 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYB561P49447 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYB561P49447 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYB561P49447 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYB561P49447 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYB561P49447 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYB561P49447 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYB561P49447 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYB561P49447 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYB561P49447 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYB561P49447 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYB561P49447 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYB561P49447 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYB561P49447 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYB561P49447 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYB561P49447 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CYB561P49447 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYB561P49447 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYB561P49447 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYB561P49447 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYB561P49447 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYB561P49447 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYB561P49447 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYB561P49447 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYB561P49447 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYB561P49447 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYB561P49447 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYB561P49447 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYB561P49447 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYB561P49447 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYB561P49447 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYB561P49447 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYB561P49447 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYB561P49447 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYB561P49447 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYB561P49447 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYB561P49447 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYB561P49447 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CYB561P49447 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYB561P49447 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYB561P49447 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYB561P49447 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYB561P49447 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYB561P49447 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYB561P49447 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYB561P49447 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYB561P49447 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYB561P49447 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CYB561P49447 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CYB561P49447 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYB561P49447 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYB561P49447 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYB561P49447 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYB561P49447 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYB561P49447 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYB561P49447 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYB561P49447 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CYB561P49447 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms