Protein–RNA interactions for Protein: P39059

COL15A1, Collagen alpha-1(XV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL15A1P39059 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
COL15A1P39059 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL15A1P39059 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL15A1P39059 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL15A1P39059 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL15A1P39059 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL15A1P39059 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL15A1P39059 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL15A1P39059 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL15A1P39059 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL15A1P39059 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL15A1P39059 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
COL15A1P39059 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL15A1P39059 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL15A1P39059 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL15A1P39059 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL15A1P39059 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL15A1P39059 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL15A1P39059 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL15A1P39059 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL15A1P39059 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
COL15A1P39059 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL15A1P39059 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL15A1P39059 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL15A1P39059 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL15A1P39059 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
COL15A1P39059 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL15A1P39059 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL15A1P39059 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL15A1P39059 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL15A1P39059 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
COL15A1P39059 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL15A1P39059 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL15A1P39059 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL15A1P39059 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL15A1P39059 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL15A1P39059 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL15A1P39059 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
COL15A1P39059 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
COL15A1P39059 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
COL15A1P39059 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL15A1P39059 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL15A1P39059 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL15A1P39059 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
COL15A1P39059 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COL15A1P39059 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL15A1P39059 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL15A1P39059 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL15A1P39059 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL15A1P39059 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL15A1P39059 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
COL15A1P39059 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL15A1P39059 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
COL15A1P39059 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL15A1P39059 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL15A1P39059 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL15A1P39059 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL15A1P39059 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL15A1P39059 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL15A1P39059 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL15A1P39059 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL15A1P39059 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL15A1P39059 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL15A1P39059 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL15A1P39059 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COL15A1P39059 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL15A1P39059 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL15A1P39059 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL15A1P39059 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL15A1P39059 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL15A1P39059 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL15A1P39059 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL15A1P39059 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL15A1P39059 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL15A1P39059 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL15A1P39059 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL15A1P39059 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL15A1P39059 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL15A1P39059 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL15A1P39059 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
COL15A1P39059 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
COL15A1P39059 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL15A1P39059 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL15A1P39059 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL15A1P39059 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL15A1P39059 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL15A1P39059 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL15A1P39059 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL15A1P39059 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL15A1P39059 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COL15A1P39059 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL15A1P39059 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL15A1P39059 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL15A1P39059 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL15A1P39059 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL15A1P39059 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL15A1P39059 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL15A1P39059 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL15A1P39059 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COL15A1P39059 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms