Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms