Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJA4P35212 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJA4P35212 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJA4P35212 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJA4P35212 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJA4P35212 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJA4P35212 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJA4P35212 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJA4P35212 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJA4P35212 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJA4P35212 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GJA4P35212 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJA4P35212 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJA4P35212 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJA4P35212 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJA4P35212 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJA4P35212 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJA4P35212 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJA4P35212 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJA4P35212 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJA4P35212 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GJA4P35212 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJA4P35212 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJA4P35212 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJA4P35212 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJA4P35212 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GJA4P35212 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJA4P35212 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJA4P35212 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJA4P35212 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJA4P35212 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJA4P35212 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJA4P35212 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJA4P35212 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJA4P35212 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GJA4P35212 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJA4P35212 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJA4P35212 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJA4P35212 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJA4P35212 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJA4P35212 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GJA4P35212 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJA4P35212 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJA4P35212 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJA4P35212 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJA4P35212 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJA4P35212 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJA4P35212 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJA4P35212 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJA4P35212 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJA4P35212 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJA4P35212 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJA4P35212 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GJA4P35212 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJA4P35212 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJA4P35212 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJA4P35212 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJA4P35212 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJA4P35212 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJA4P35212 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJA4P35212 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GJA4P35212 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJA4P35212 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJA4P35212 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJA4P35212 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJA4P35212 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJA4P35212 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJA4P35212 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJA4P35212 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJA4P35212 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJA4P35212 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJA4P35212 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJA4P35212 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GJA4P35212 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJA4P35212 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJA4P35212 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJA4P35212 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJA4P35212 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GJA4P35212 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJA4P35212 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GJA4P35212 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJA4P35212 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJA4P35212 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJA4P35212 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJA4P35212 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJA4P35212 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJA4P35212 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJA4P35212 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJA4P35212 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GJA4P35212 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJA4P35212 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJA4P35212 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJA4P35212 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJA4P35212 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJA4P35212 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJA4P35212 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJA4P35212 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJA4P35212 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJA4P35212 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJA4P35212 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms