Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CMPK1P30085 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms