Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2E1P29083 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms