Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PTPRMP28827 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRMP28827 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms