Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMGB2P26583 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms