Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTX3P26022 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTX3P26022 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTX3P26022 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTX3P26022 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTX3P26022 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PTX3P26022 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTX3P26022 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PTX3P26022 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTX3P26022 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTX3P26022 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTX3P26022 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTX3P26022 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PTX3P26022 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTX3P26022 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTX3P26022 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTX3P26022 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTX3P26022 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTX3P26022 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTX3P26022 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTX3P26022 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTX3P26022 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
PTX3P26022 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PTX3P26022 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PTX3P26022 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PTX3P26022 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PTX3P26022 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTX3P26022 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTX3P26022 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTX3P26022 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTX3P26022 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTX3P26022 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTX3P26022 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTX3P26022 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTX3P26022 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTX3P26022 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTX3P26022 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTX3P26022 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTX3P26022 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTX3P26022 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTX3P26022 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTX3P26022 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTX3P26022 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTX3P26022 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTX3P26022 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PTX3P26022 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PTX3P26022 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTX3P26022 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTX3P26022 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTX3P26022 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTX3P26022 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTX3P26022 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTX3P26022 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTX3P26022 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PTX3P26022 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTX3P26022 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTX3P26022 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTX3P26022 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTX3P26022 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTX3P26022 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTX3P26022 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTX3P26022 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTX3P26022 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTX3P26022 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTX3P26022 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTX3P26022 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTX3P26022 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTX3P26022 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTX3P26022 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTX3P26022 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTX3P26022 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTX3P26022 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTX3P26022 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTX3P26022 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTX3P26022 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PTX3P26022 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTX3P26022 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTX3P26022 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTX3P26022 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTX3P26022 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PTX3P26022 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTX3P26022 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTX3P26022 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTX3P26022 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTX3P26022 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTX3P26022 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTX3P26022 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTX3P26022 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTX3P26022 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTX3P26022 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTX3P26022 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTX3P26022 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTX3P26022 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTX3P26022 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTX3P26022 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTX3P26022 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTX3P26022 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTX3P26022 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTX3P26022 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTX3P26022 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms