Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMA4P25789 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMA4P25789 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMA4P25789 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMA4P25789 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMA4P25789 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMA4P25789 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMA4P25789 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMA4P25789 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMA4P25789 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMA4P25789 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMA4P25789 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMA4P25789 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMA4P25789 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMA4P25789 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMA4P25789 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMA4P25789 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMA4P25789 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMA4P25789 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMA4P25789 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMA4P25789 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMA4P25789 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMA4P25789 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMA4P25789 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMA4P25789 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMA4P25789 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMA4P25789 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMA4P25789 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMA4P25789 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMA4P25789 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMA4P25789 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMA4P25789 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMA4P25789 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMA4P25789 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMA4P25789 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMA4P25789 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMA4P25789 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMA4P25789 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMA4P25789 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMA4P25789 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMA4P25789 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMA4P25789 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMA4P25789 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMA4P25789 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMA4P25789 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMA4P25789 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMA4P25789 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMA4P25789 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMA4P25789 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMA4P25789 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMA4P25789 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMA4P25789 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMA4P25789 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMA4P25789 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMA4P25789 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMA4P25789 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMA4P25789 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMA4P25789 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMA4P25789 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMA4P25789 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMA4P25789 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMA4P25789 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMA4P25789 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMA4P25789 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMA4P25789 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMA4P25789 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMA4P25789 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMA4P25789 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMA4P25789 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMA4P25789 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMA4P25789 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMA4P25789 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMA4P25789 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMA4P25789 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMA4P25789 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMA4P25789 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMA4P25789 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMA4P25789 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMA4P25789 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMA4P25789 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMA4P25789 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PSMA4P25789 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PSMA4P25789 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA4P25789 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA4P25789 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA4P25789 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA4P25789 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA4P25789 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA4P25789 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA4P25789 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA4P25789 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA4P25789 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA4P25789 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA4P25789 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA4P25789 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA4P25789 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA4P25789 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA4P25789 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA4P25789 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMA4P25789 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms