Protein–RNA interactions for Protein: P24311

COX7B, Cytochrome c oxidase subunit 7B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX7BP24311 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX7BP24311 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX7BP24311 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX7BP24311 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX7BP24311 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX7BP24311 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX7BP24311 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX7BP24311 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
COX7BP24311 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX7BP24311 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX7BP24311 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX7BP24311 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX7BP24311 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX7BP24311 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX7BP24311 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX7BP24311 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
COX7BP24311 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX7BP24311 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX7BP24311 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX7BP24311 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX7BP24311 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX7BP24311 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX7BP24311 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX7BP24311 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX7BP24311 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX7BP24311 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX7BP24311 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX7BP24311 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX7BP24311 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX7BP24311 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX7BP24311 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX7BP24311 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX7BP24311 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX7BP24311 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX7BP24311 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX7BP24311 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX7BP24311 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
COX7BP24311 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
COX7BP24311 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
COX7BP24311 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
COX7BP24311 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
COX7BP24311 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
COX7BP24311 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
COX7BP24311 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
COX7BP24311 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
COX7BP24311 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
COX7BP24311 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
COX7BP24311 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
COX7BP24311 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
COX7BP24311 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
COX7BP24311 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
COX7BP24311 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
COX7BP24311 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
COX7BP24311 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
COX7BP24311 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
COX7BP24311 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
COX7BP24311 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
COX7BP24311 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
COX7BP24311 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
COX7BP24311 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
COX7BP24311 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
COX7BP24311 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
COX7BP24311 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
COX7BP24311 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
COX7BP24311 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
COX7BP24311 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
COX7BP24311 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
COX7BP24311 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
COX7BP24311 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
COX7BP24311 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
COX7BP24311 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
COX7BP24311 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
COX7BP24311 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
COX7BP24311 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
COX7BP24311 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
COX7BP24311 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
COX7BP24311 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
COX7BP24311 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
COX7BP24311 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
COX7BP24311 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
COX7BP24311 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
COX7BP24311 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
COX7BP24311 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
COX7BP24311 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
COX7BP24311 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
COX7BP24311 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
COX7BP24311 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
COX7BP24311 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
COX7BP24311 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
COX7BP24311 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
COX7BP24311 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
COX7BP24311 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
COX7BP24311 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
COX7BP24311 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
COX7BP24311 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
COX7BP24311 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
COX7BP24311 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
COX7BP24311 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
COX7BP24311 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
COX7BP24311 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms