Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPS6KB1P23443 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms