Protein–RNA interactions for Protein: P22415

USF1, Upstream stimulatory factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1P22415 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USF1P22415 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USF1P22415 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USF1P22415 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USF1P22415 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USF1P22415 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USF1P22415 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USF1P22415 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USF1P22415 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USF1P22415 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USF1P22415 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USF1P22415 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USF1P22415 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USF1P22415 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USF1P22415 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USF1P22415 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USF1P22415 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USF1P22415 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
USF1P22415 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USF1P22415 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USF1P22415 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
USF1P22415 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USF1P22415 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USF1P22415 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USF1P22415 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USF1P22415 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USF1P22415 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USF1P22415 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USF1P22415 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USF1P22415 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USF1P22415 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USF1P22415 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USF1P22415 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USF1P22415 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USF1P22415 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
USF1P22415 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USF1P22415 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USF1P22415 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USF1P22415 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USF1P22415 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USF1P22415 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USF1P22415 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USF1P22415 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USF1P22415 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USF1P22415 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USF1P22415 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USF1P22415 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USF1P22415 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USF1P22415 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USF1P22415 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USF1P22415 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USF1P22415 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USF1P22415 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USF1P22415 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
USF1P22415 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USF1P22415 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
USF1P22415 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USF1P22415 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
USF1P22415 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USF1P22415 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USF1P22415 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USF1P22415 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USF1P22415 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USF1P22415 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USF1P22415 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USF1P22415 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
USF1P22415 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USF1P22415 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USF1P22415 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USF1P22415 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USF1P22415 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USF1P22415 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USF1P22415 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USF1P22415 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USF1P22415 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USF1P22415 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USF1P22415 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USF1P22415 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF1P22415 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF1P22415 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF1P22415 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF1P22415 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF1P22415 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF1P22415 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF1P22415 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF1P22415 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF1P22415 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF1P22415 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF1P22415 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF1P22415 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF1P22415 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
USF1P22415 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF1P22415 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
USF1P22415 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF1P22415 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF1P22415 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF1P22415 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF1P22415 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF1P22415 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USF1P22415 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms