Protein–RNA interactions for Protein: P20823

HNF1A, Hepatocyte nuclear factor 1-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF1AP20823 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HNF1AP20823 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HNF1AP20823 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HNF1AP20823 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HNF1AP20823 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HNF1AP20823 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HNF1AP20823 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HNF1AP20823 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HNF1AP20823 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HNF1AP20823 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HNF1AP20823 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HNF1AP20823 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms