Protein–RNA interactions for Protein: P20749

BCL3, B-cell lymphoma 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL3P20749 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCL3P20749 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BCL3P20749 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCL3P20749 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCL3P20749 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCL3P20749 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCL3P20749 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCL3P20749 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCL3P20749 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCL3P20749 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCL3P20749 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCL3P20749 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCL3P20749 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCL3P20749 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCL3P20749 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCL3P20749 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCL3P20749 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCL3P20749 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCL3P20749 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCL3P20749 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCL3P20749 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCL3P20749 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCL3P20749 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCL3P20749 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCL3P20749 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCL3P20749 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BCL3P20749 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCL3P20749 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BCL3P20749 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCL3P20749 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCL3P20749 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCL3P20749 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCL3P20749 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCL3P20749 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCL3P20749 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCL3P20749 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCL3P20749 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCL3P20749 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCL3P20749 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCL3P20749 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCL3P20749 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCL3P20749 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCL3P20749 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCL3P20749 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCL3P20749 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCL3P20749 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCL3P20749 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCL3P20749 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCL3P20749 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BCL3P20749 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCL3P20749 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCL3P20749 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCL3P20749 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCL3P20749 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCL3P20749 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCL3P20749 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCL3P20749 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCL3P20749 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCL3P20749 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCL3P20749 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCL3P20749 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCL3P20749 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCL3P20749 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCL3P20749 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCL3P20749 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCL3P20749 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCL3P20749 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCL3P20749 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCL3P20749 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCL3P20749 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCL3P20749 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCL3P20749 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BCL3P20749 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BCL3P20749 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCL3P20749 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCL3P20749 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCL3P20749 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCL3P20749 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCL3P20749 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCL3P20749 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCL3P20749 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCL3P20749 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCL3P20749 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCL3P20749 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCL3P20749 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCL3P20749 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCL3P20749 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCL3P20749 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BCL3P20749 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BCL3P20749 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BCL3P20749 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BCL3P20749 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BCL3P20749 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BCL3P20749 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BCL3P20749 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BCL3P20749 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BCL3P20749 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BCL3P20749 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BCL3P20749 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BCL3P20749 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms