Protein–RNA interactions for Protein: P18754

RCC1, Regulator of chromosome condensation, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC1P18754 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCC1P18754 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCC1P18754 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCC1P18754 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCC1P18754 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RCC1P18754 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RCC1P18754 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RCC1P18754 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RCC1P18754 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RCC1P18754 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RCC1P18754 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RCC1P18754 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RCC1P18754 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RCC1P18754 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RCC1P18754 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RCC1P18754 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RCC1P18754 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RCC1P18754 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RCC1P18754 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RCC1P18754 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RCC1P18754 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RCC1P18754 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RCC1P18754 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RCC1P18754 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RCC1P18754 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RCC1P18754 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RCC1P18754 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RCC1P18754 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RCC1P18754 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RCC1P18754 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RCC1P18754 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RCC1P18754 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RCC1P18754 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RCC1P18754 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RCC1P18754 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RCC1P18754 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RCC1P18754 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RCC1P18754 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCC1P18754 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCC1P18754 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCC1P18754 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCC1P18754 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCC1P18754 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCC1P18754 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCC1P18754 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCC1P18754 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCC1P18754 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCC1P18754 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCC1P18754 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCC1P18754 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCC1P18754 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCC1P18754 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCC1P18754 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCC1P18754 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCC1P18754 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCC1P18754 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCC1P18754 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RCC1P18754 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCC1P18754 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCC1P18754 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCC1P18754 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCC1P18754 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RCC1P18754 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RCC1P18754 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCC1P18754 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCC1P18754 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCC1P18754 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCC1P18754 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCC1P18754 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCC1P18754 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCC1P18754 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCC1P18754 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCC1P18754 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCC1P18754 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCC1P18754 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCC1P18754 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCC1P18754 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCC1P18754 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCC1P18754 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCC1P18754 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCC1P18754 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCC1P18754 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCC1P18754 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCC1P18754 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCC1P18754 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCC1P18754 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCC1P18754 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RCC1P18754 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCC1P18754 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCC1P18754 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCC1P18754 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCC1P18754 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCC1P18754 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCC1P18754 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCC1P18754 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCC1P18754 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCC1P18754 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCC1P18754 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RCC1P18754 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RCC1P18754 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms