Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXB4P17483 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXB4P17483 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms