Protein–RNA interactions for Protein: P17029

ZKSCAN1, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN1P17029 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZKSCAN1P17029 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZKSCAN1P17029 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZKSCAN1P17029 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZKSCAN1P17029 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZKSCAN1P17029 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZKSCAN1P17029 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZKSCAN1P17029 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZKSCAN1P17029 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZKSCAN1P17029 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZKSCAN1P17029 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZKSCAN1P17029 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZKSCAN1P17029 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZKSCAN1P17029 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZKSCAN1P17029 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZKSCAN1P17029 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZKSCAN1P17029 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ZKSCAN1P17029 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ZKSCAN1P17029 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZKSCAN1P17029 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZKSCAN1P17029 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZKSCAN1P17029 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ZKSCAN1P17029 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ZKSCAN1P17029 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ZKSCAN1P17029 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ZKSCAN1P17029 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZKSCAN1P17029 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZKSCAN1P17029 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZKSCAN1P17029 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZKSCAN1P17029 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ZKSCAN1P17029 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZKSCAN1P17029 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZKSCAN1P17029 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZKSCAN1P17029 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZKSCAN1P17029 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZKSCAN1P17029 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZKSCAN1P17029 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZKSCAN1P17029 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZKSCAN1P17029 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZKSCAN1P17029 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZKSCAN1P17029 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZKSCAN1P17029 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ZKSCAN1P17029 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ZKSCAN1P17029 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZKSCAN1P17029 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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