Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCL3L1P16619 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCL3L1P16619 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CCL3L1P16619 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCL3L1P16619 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CCL3L1P16619 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
CCL3L1P16619 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCL3L1P16619 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCL3L1P16619 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCL3L1P16619 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCL3L1P16619 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CCL3L1P16619 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
CCL3L1P16619 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CCL3L1P16619 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
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CCL3L1P16619 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CCL3L1P16619 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CCL3L1P16619 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
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CCL3L1P16619 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCL3L1P16619 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
CCL3L1P16619 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCL3L1P16619 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCL3L1P16619 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCL3L1P16619 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCL3L1P16619 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCL3L1P16619 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCL3L1P16619 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCL3L1P16619 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CCL3L1P16619 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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CCL3L1P16619 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCL3L1P16619 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CCL3L1P16619 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCL3L1P16619 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CCL3L1P16619 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CCL3L1P16619 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCL3L1P16619 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CCL3L1P16619 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CCL3L1P16619 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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CCL3L1P16619 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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CCL3L1P16619 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCL3L1P16619 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCL3L1P16619 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCL3L1P16619 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CCL3L1P16619 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CCL3L1P16619 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CCL3L1P16619 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CCL3L1P16619 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CCL3L1P16619 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CCL3L1P16619 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CCL3L1P16619 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CCL3L1P16619 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCL3L1P16619 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCL3L1P16619 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCL3L1P16619 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCL3L1P16619 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CCL3L1P16619 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCL3L1P16619 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCL3L1P16619 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCL3L1P16619 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCL3L1P16619 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCL3L1P16619 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCL3L1P16619 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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