Protein–RNA interactions for Protein: P14854

COX6B1, Cytochrome c oxidase subunit 6B1, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6B1P14854 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX6B1P14854 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX6B1P14854 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX6B1P14854 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX6B1P14854 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX6B1P14854 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX6B1P14854 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX6B1P14854 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX6B1P14854 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX6B1P14854 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX6B1P14854 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX6B1P14854 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX6B1P14854 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX6B1P14854 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX6B1P14854 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX6B1P14854 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX6B1P14854 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX6B1P14854 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX6B1P14854 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX6B1P14854 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX6B1P14854 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX6B1P14854 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COX6B1P14854 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX6B1P14854 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX6B1P14854 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX6B1P14854 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COX6B1P14854 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COX6B1P14854 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX6B1P14854 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX6B1P14854 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX6B1P14854 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX6B1P14854 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX6B1P14854 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX6B1P14854 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX6B1P14854 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX6B1P14854 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX6B1P14854 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX6B1P14854 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX6B1P14854 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX6B1P14854 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX6B1P14854 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX6B1P14854 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX6B1P14854 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX6B1P14854 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX6B1P14854 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX6B1P14854 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX6B1P14854 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX6B1P14854 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX6B1P14854 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX6B1P14854 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX6B1P14854 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX6B1P14854 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX6B1P14854 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX6B1P14854 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX6B1P14854 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX6B1P14854 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX6B1P14854 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX6B1P14854 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX6B1P14854 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX6B1P14854 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX6B1P14854 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX6B1P14854 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX6B1P14854 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX6B1P14854 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX6B1P14854 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX6B1P14854 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX6B1P14854 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX6B1P14854 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX6B1P14854 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX6B1P14854 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX6B1P14854 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
COX6B1P14854 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COX6B1P14854 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COX6B1P14854 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COX6B1P14854 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COX6B1P14854 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COX6B1P14854 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COX6B1P14854 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
COX6B1P14854 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
COX6B1P14854 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COX6B1P14854 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COX6B1P14854 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
COX6B1P14854 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COX6B1P14854 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COX6B1P14854 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COX6B1P14854 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COX6B1P14854 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COX6B1P14854 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COX6B1P14854 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COX6B1P14854 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COX6B1P14854 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
COX6B1P14854 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COX6B1P14854 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COX6B1P14854 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COX6B1P14854 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
COX6B1P14854 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COX6B1P14854 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
COX6B1P14854 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COX6B1P14854 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
COX6B1P14854 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms