Protein–RNA interactions for Protein: P13984

GTF2F2, General transcription factor IIF subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F2P13984 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GTF2F2P13984 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2F2P13984 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2F2P13984 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2F2P13984 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2F2P13984 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2F2P13984 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2F2P13984 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2F2P13984 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2F2P13984 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2F2P13984 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2F2P13984 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2F2P13984 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2F2P13984 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2F2P13984 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2F2P13984 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2F2P13984 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2F2P13984 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2F2P13984 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2F2P13984 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2F2P13984 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2F2P13984 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2F2P13984 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2F2P13984 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2F2P13984 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2F2P13984 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2F2P13984 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2F2P13984 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2F2P13984 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GTF2F2P13984 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2F2P13984 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2F2P13984 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2F2P13984 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2F2P13984 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2F2P13984 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2F2P13984 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GTF2F2P13984 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms