Protein–RNA interactions for Protein: P12074

COX6A1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A1P12074 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COX6A1P12074 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COX6A1P12074 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COX6A1P12074 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COX6A1P12074 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COX6A1P12074 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COX6A1P12074 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COX6A1P12074 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COX6A1P12074 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COX6A1P12074 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COX6A1P12074 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COX6A1P12074 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COX6A1P12074 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COX6A1P12074 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COX6A1P12074 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COX6A1P12074 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COX6A1P12074 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COX6A1P12074 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COX6A1P12074 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COX6A1P12074 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COX6A1P12074 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
COX6A1P12074 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COX6A1P12074 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COX6A1P12074 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COX6A1P12074 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COX6A1P12074 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COX6A1P12074 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COX6A1P12074 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COX6A1P12074 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COX6A1P12074 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
COX6A1P12074 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COX6A1P12074 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COX6A1P12074 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COX6A1P12074 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COX6A1P12074 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COX6A1P12074 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COX6A1P12074 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COX6A1P12074 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
COX6A1P12074 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COX6A1P12074 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COX6A1P12074 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COX6A1P12074 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COX6A1P12074 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COX6A1P12074 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COX6A1P12074 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COX6A1P12074 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COX6A1P12074 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COX6A1P12074 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COX6A1P12074 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COX6A1P12074 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COX6A1P12074 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COX6A1P12074 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COX6A1P12074 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COX6A1P12074 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COX6A1P12074 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COX6A1P12074 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COX6A1P12074 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COX6A1P12074 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COX6A1P12074 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
COX6A1P12074 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
COX6A1P12074 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
COX6A1P12074 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
COX6A1P12074 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
COX6A1P12074 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COX6A1P12074 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COX6A1P12074 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COX6A1P12074 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COX6A1P12074 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COX6A1P12074 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COX6A1P12074 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COX6A1P12074 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COX6A1P12074 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COX6A1P12074 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COX6A1P12074 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COX6A1P12074 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COX6A1P12074 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COX6A1P12074 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COX6A1P12074 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COX6A1P12074 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COX6A1P12074 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COX6A1P12074 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
COX6A1P12074 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COX6A1P12074 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COX6A1P12074 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COX6A1P12074 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COX6A1P12074 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COX6A1P12074 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
COX6A1P12074 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COX6A1P12074 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COX6A1P12074 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COX6A1P12074 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COX6A1P12074 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COX6A1P12074 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COX6A1P12074 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
COX6A1P12074 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COX6A1P12074 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COX6A1P12074 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COX6A1P12074 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COX6A1P12074 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
COX6A1P12074 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms