Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MS4A1P11836 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms