Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms