Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PGA3P0DJD8 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms