Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGB3P05106 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms