Protein–RNA interactions for Protein: P04920

SLC4A2, Anion exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A2P04920 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A2P04920 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A2P04920 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A2P04920 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A2P04920 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A2P04920 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A2P04920 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A2P04920 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A2P04920 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC4A2P04920 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A2P04920 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A2P04920 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A2P04920 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A2P04920 SMIM11A-201ENST00000399292 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A2P04920 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A2P04920 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A2P04920 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A2P04920 AL079304.1-201ENST00000554595 828 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A2P04920 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A2P04920 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A2P04920 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A2P04920 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A2P04920 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A2P04920 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A2P04920 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC4A2P04920 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A2P04920 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A2P04920 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A2P04920 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A2P04920 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A2P04920 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A2P04920 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A2P04920 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A2P04920 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A2P04920 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A2P04920 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A2P04920 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A2P04920 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A2P04920 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A2P04920 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A2P04920 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A2P04920 ZNF331-218ENST00000513265 739 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A2P04920 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A2P04920 AC022960.2-201ENST00000616300 666 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A2P04920 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A2P04920 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A2P04920 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A2P04920 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A2P04920 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A2P04920 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A2P04920 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A2P04920 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC4A2P04920 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A2P04920 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A2P04920 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A2P04920 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A2P04920 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A2P04920 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A2P04920 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A2P04920 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A2P04920 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A2P04920 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A2P04920 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A2P04920 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A2P04920 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A2P04920 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A2P04920 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A2P04920 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A2P04920 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A2P04920 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A2P04920 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A2P04920 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A2P04920 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A2P04920 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A2P04920 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A2P04920 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A2P04920 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A2P04920 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A2P04920 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A2P04920 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A2P04920 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A2P04920 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A2P04920 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A2P04920 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC4A2P04920 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A2P04920 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A2P04920 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A2P04920 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A2P04920 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A2P04920 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A2P04920 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A2P04920 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A2P04920 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A2P04920 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A2P04920 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A2P04920 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A2P04920 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A2P04920 SLC14A1-206ENST00000535474 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A2P04920 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC4A2P04920 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms