Protein–RNA interactions for Protein: P01893

HLA-H, Putative HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain H, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-HP01893 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-HP01893 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms