Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC24BO95487 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC24BO95487 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms