Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG7O95352 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG7O95352 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG7O95352 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG7O95352 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG7O95352 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG7O95352 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG7O95352 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG7O95352 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG7O95352 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG7O95352 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG7O95352 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG7O95352 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG7O95352 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG7O95352 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG7O95352 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG7O95352 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG7O95352 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG7O95352 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG7O95352 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG7O95352 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG7O95352 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG7O95352 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG7O95352 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG7O95352 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG7O95352 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG7O95352 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG7O95352 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG7O95352 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG7O95352 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG7O95352 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG7O95352 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG7O95352 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG7O95352 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG7O95352 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG7O95352 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG7O95352 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG7O95352 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG7O95352 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG7O95352 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG7O95352 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG7O95352 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG7O95352 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG7O95352 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG7O95352 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG7O95352 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG7O95352 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG7O95352 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG7O95352 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG7O95352 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG7O95352 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG7O95352 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG7O95352 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG7O95352 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG7O95352 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG7O95352 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG7O95352 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG7O95352 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG7O95352 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG7O95352 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG7O95352 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG7O95352 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG7O95352 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG7O95352 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG7O95352 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG7O95352 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG7O95352 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG7O95352 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG7O95352 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG7O95352 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG7O95352 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG7O95352 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG7O95352 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG7O95352 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG7O95352 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG7O95352 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG7O95352 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG7O95352 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG7O95352 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG7O95352 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG7O95352 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG7O95352 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG7O95352 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG7O95352 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG7O95352 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG7O95352 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG7O95352 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG7O95352 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG7O95352 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG7O95352 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG7O95352 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG7O95352 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG7O95352 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG7O95352 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG7O95352 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG7O95352 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG7O95352 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG7O95352 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG7O95352 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG7O95352 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms