Protein–RNA interactions for Protein: O94874

UFL1, E3 UFM1-protein ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFL1O94874 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UFL1O94874 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
UFL1O94874 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UFL1O94874 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UFL1O94874 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UFL1O94874 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UFL1O94874 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UFL1O94874 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UFL1O94874 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UFL1O94874 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UFL1O94874 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UFL1O94874 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UFL1O94874 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UFL1O94874 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UFL1O94874 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UFL1O94874 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UFL1O94874 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UFL1O94874 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UFL1O94874 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UFL1O94874 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UFL1O94874 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UFL1O94874 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UFL1O94874 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UFL1O94874 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UFL1O94874 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UFL1O94874 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UFL1O94874 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UFL1O94874 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UFL1O94874 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UFL1O94874 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UFL1O94874 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UFL1O94874 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UFL1O94874 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UFL1O94874 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UFL1O94874 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UFL1O94874 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UFL1O94874 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
UFL1O94874 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
UFL1O94874 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UFL1O94874 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
UFL1O94874 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UFL1O94874 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UFL1O94874 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
UFL1O94874 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UFL1O94874 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UFL1O94874 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UFL1O94874 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UFL1O94874 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UFL1O94874 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UFL1O94874 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UFL1O94874 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UFL1O94874 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UFL1O94874 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UFL1O94874 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UFL1O94874 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UFL1O94874 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UFL1O94874 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UFL1O94874 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UFL1O94874 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UFL1O94874 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UFL1O94874 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
UFL1O94874 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
UFL1O94874 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
UFL1O94874 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UFL1O94874 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
UFL1O94874 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UFL1O94874 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UFL1O94874 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UFL1O94874 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UFL1O94874 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
UFL1O94874 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
UFL1O94874 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UFL1O94874 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UFL1O94874 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
UFL1O94874 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UFL1O94874 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UFL1O94874 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UFL1O94874 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UFL1O94874 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UFL1O94874 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UFL1O94874 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UFL1O94874 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
UFL1O94874 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UFL1O94874 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UFL1O94874 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UFL1O94874 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UFL1O94874 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UFL1O94874 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UFL1O94874 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UFL1O94874 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
UFL1O94874 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UFL1O94874 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UFL1O94874 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UFL1O94874 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UFL1O94874 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UFL1O94874 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UFL1O94874 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UFL1O94874 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UFL1O94874 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UFL1O94874 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms