Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NIPSNAP2O75323 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms