Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SIN3BO75182 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SIN3BO75182 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms