Protein–RNA interactions for Protein: O75177

SS18L1, Calcium-responsive transactivator, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L1O75177 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SS18L1O75177 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SS18L1O75177 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms