Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTNSO60931 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTNSO60931 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTNSO60931 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTNSO60931 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTNSO60931 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTNSO60931 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTNSO60931 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTNSO60931 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CTNSO60931 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTNSO60931 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTNSO60931 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTNSO60931 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTNSO60931 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTNSO60931 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CTNSO60931 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNSO60931 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNSO60931 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNSO60931 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNSO60931 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNSO60931 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNSO60931 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNSO60931 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNSO60931 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNSO60931 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNSO60931 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNSO60931 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNSO60931 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNSO60931 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNSO60931 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNSO60931 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNSO60931 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNSO60931 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNSO60931 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNSO60931 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNSO60931 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNSO60931 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNSO60931 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNSO60931 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNSO60931 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNSO60931 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNSO60931 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNSO60931 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNSO60931 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNSO60931 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNSO60931 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNSO60931 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNSO60931 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNSO60931 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNSO60931 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNSO60931 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNSO60931 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNSO60931 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CTNSO60931 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNSO60931 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNSO60931 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNSO60931 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNSO60931 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNSO60931 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNSO60931 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNSO60931 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNSO60931 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNSO60931 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNSO60931 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNSO60931 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNSO60931 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNSO60931 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNSO60931 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNSO60931 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNSO60931 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNSO60931 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNSO60931 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNSO60931 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNSO60931 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNSO60931 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNSO60931 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNSO60931 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNSO60931 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNSO60931 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNSO60931 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CTNSO60931 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTNSO60931 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTNSO60931 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTNSO60931 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTNSO60931 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTNSO60931 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTNSO60931 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CTNSO60931 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNSO60931 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNSO60931 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNSO60931 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNSO60931 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNSO60931 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNSO60931 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNSO60931 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNSO60931 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNSO60931 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNSO60931 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNSO60931 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CTNSO60931 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms