Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CXCL13O43927 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms