Protein–RNA interactions for Protein: O43196

MSH5, MutS protein homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSH5O43196 AC096759.2-202ENST00000515230 777 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MSH5O43196 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MSH5O43196 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MSH5O43196 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MSH5O43196 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MSH5O43196 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MSH5O43196 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MSH5O43196 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MSH5O43196 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MSH5O43196 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MSH5O43196 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MSH5O43196 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MSH5O43196 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MSH5O43196 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MSH5O43196 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MSH5O43196 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MSH5O43196 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MSH5O43196 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MSH5O43196 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MSH5O43196 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MSH5O43196 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MSH5O43196 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MSH5O43196 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MSH5O43196 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MSH5O43196 AL121578.1-201ENST00000428051 892 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MSH5O43196 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MSH5O43196 TYW3-205ENST00000479111 1130 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MSH5O43196 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MSH5O43196 AP001505.1-201ENST00000569966 824 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MSH5O43196 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MSH5O43196 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MSH5O43196 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MSH5O43196 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MSH5O43196 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MSH5O43196 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MSH5O43196 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MSH5O43196 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MSH5O43196 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MSH5O43196 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MSH5O43196 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MSH5O43196 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MSH5O43196 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MSH5O43196 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MSH5O43196 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MSH5O43196 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MSH5O43196 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MSH5O43196 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MSH5O43196 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MSH5O43196 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MSH5O43196 RBMS1-204ENST00000409289 1490 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MSH5O43196 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MSH5O43196 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MSH5O43196 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MSH5O43196 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MSH5O43196 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MSH5O43196 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MSH5O43196 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MSH5O43196 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MSH5O43196 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MSH5O43196 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MSH5O43196 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MSH5O43196 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MSH5O43196 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MSH5O43196 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MSH5O43196 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MSH5O43196 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MSH5O43196 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MSH5O43196 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MSH5O43196 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MSH5O43196 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MSH5O43196 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MSH5O43196 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MSH5O43196 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MSH5O43196 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MSH5O43196 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MSH5O43196 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MSH5O43196 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MSH5O43196 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MSH5O43196 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MSH5O43196 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MSH5O43196 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MSH5O43196 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MSH5O43196 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MSH5O43196 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MSH5O43196 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MSH5O43196 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MSH5O43196 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MSH5O43196 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MSH5O43196 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MSH5O43196 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MSH5O43196 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MSH5O43196 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MSH5O43196 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MSH5O43196 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MSH5O43196 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MSH5O43196 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MSH5O43196 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MSH5O43196 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MSH5O43196 TERB2-201ENST00000340827 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MSH5O43196 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 234.8 ms