Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF1O43189 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF1O43189 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF1O43189 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF1O43189 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF1O43189 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF1O43189 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF1O43189 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF1O43189 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF1O43189 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF1O43189 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF1O43189 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PHF1O43189 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF1O43189 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF1O43189 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF1O43189 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF1O43189 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF1O43189 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF1O43189 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF1O43189 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF1O43189 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF1O43189 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF1O43189 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF1O43189 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF1O43189 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF1O43189 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF1O43189 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF1O43189 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF1O43189 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF1O43189 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF1O43189 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF1O43189 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF1O43189 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF1O43189 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF1O43189 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF1O43189 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF1O43189 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF1O43189 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF1O43189 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF1O43189 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF1O43189 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF1O43189 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF1O43189 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF1O43189 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF1O43189 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF1O43189 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF1O43189 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF1O43189 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF1O43189 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF1O43189 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF1O43189 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF1O43189 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF1O43189 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF1O43189 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF1O43189 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF1O43189 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF1O43189 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF1O43189 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF1O43189 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF1O43189 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF1O43189 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF1O43189 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF1O43189 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF1O43189 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF1O43189 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF1O43189 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF1O43189 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF1O43189 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF1O43189 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF1O43189 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF1O43189 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF1O43189 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF1O43189 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF1O43189 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF1O43189 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF1O43189 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF1O43189 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF1O43189 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF1O43189 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF1O43189 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF1O43189 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF1O43189 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF1O43189 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF1O43189 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF1O43189 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF1O43189 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF1O43189 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF1O43189 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF1O43189 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF1O43189 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF1O43189 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF1O43189 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF1O43189 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF1O43189 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF1O43189 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF1O43189 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF1O43189 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF1O43189 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF1O43189 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF1O43189 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms