Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SETD1AO15047 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SETD1AO15047 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms