Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRTO14522 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRTO14522 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
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