Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BHLHE40O14503 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms