Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NEDD8-MDP1E9PL57 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms