Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
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USP17L12C9JPN9 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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USP17L12C9JPN9 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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USP17L12C9JPN9 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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USP17L12C9JPN9 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L12C9JPN9 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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