Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PATL2C9JE40 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms