Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN25C9JDP6 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
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