Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRDCB7Z8K6 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms