Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ERVV-1B6SEH8 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVV-1B6SEH8 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms